基础医学实验教学中心成立于2012年，是广东医科大学首批广东省实验教学示范中心（2015年），广东省虚拟仿真实验教学示范中心（2019年）。中心依托基础医学院，参与建设国家级一流课程2门，省级一流课程8门，省级及校级课程思政改革项目17项，在教学、科研及课程思政等多个方面对我校本科、硕士研究生、博士研究生等各层次人才培养与教学研究工作作出了贡献。

中心近年来在学校学院两级党组织的领导下，在学校资产与实验室管理处的指导下，积极组织学院所属各实验室进行定期和不定期的实验室安全巡查及消防安全演练，近三年组织实验室师生参与实验室安全培训300人次，消防安全演习6次，生物安全演练3次，切实把实验室安全工作做细做实。

截至2023年年中，基础医学实验教学中心协助基础医学院共建设、管理了两校区近159间实验教学课室、19间实验准备室，固定资产设备总数量8831部，约合7882万元。中心设兼职主任一名、兼职副主任两名，各学科、专业专职实验人员45名，其中硕士占比超20%。中心每年承担并组织实施了基础医学院、公共卫生学院、护理学院、药学院、第一临床医学院、第二临床医学院等6个学院的近4000名学生、200余个实验单元、累计6000多学时的教学任务。中心承担课程涵盖全校所有医学或非医学专业学生的全部基础医学公共课程所需的实验内容，并正在努力完善中心所属的广东省虚拟仿真实验教学示范中心资源课程，以期在新医科发展进程中，逐步完善线上线下教学平台及其资源库，为我校师生人才培养和高水平大学建设奠定基础。